空路

琉球エアーコミューター（RAC）
那覇空港―与那国空港：　1日1便
南ぬ島石垣空港―与那国空港：　1日3便

海路

福山海運　フェーリーよなくに
石垣島（石垣港フェリーターミナル）―与那国島（久部良港）：　週4便（2往復）
石垣発（10:00）―与那国着（14:00）毎週火曜日・金曜日
与那国発（10:00）―石垣着（14:00）毎週水曜日・土曜日

東京から

• 羽田空港―（JTA／ANA）―南ぬ島 石垣空港―（RAC）―与那国空港
• 羽田空港―（JTA／ANA）―南ぬ島 石垣空港―石垣島石垣港フェリーターミナル―（フェリ―よなくに）―与那国島久部良港
• 羽田空港―（JTA／ANA）―那覇空港―（RAC）―与那国空港
• 成田空港―（JTA／ANA／Peach）―那覇空港―（RAC）―与那国空港

関西から

• 関西国際空港―（JTA／ANA／Peach）―南ぬ島 石垣空港―（RAC）―与那国空港
• 関西国際空港―（JTA／ANA／Peach）―南ぬ島 石垣空港―石垣島石垣港フェリーターミナル―（フェリ―よなくに）―与那国島久部良港
• 伊丹空港―（ANA）―南ぬ島 石垣空港―（RAC）―与那国空港
• 伊丹空港―（ANA）―南ぬ島 石垣空港―石垣島石垣港フェリーターミナル―（フェリ―よなくに）―与那国島久部良港